Hanna palaa Meadowsiin säilyttäen uskottavuutensa lojaalina koulutettavana kiitos ohjelmanjohtaja John Carmichaelin, jonka Marissa on pakottanut avukseen. Kun koulutettavat valmistautuvat ensimmäisiin tehtäviinsä, Marissa ottaa Wienissä yhteyden kohdelistalla olevaan CIA:n analyytikkoon ja hankkii tältä tietoja. Pariisissa Hanna tapaa oman kohteensa Abbasin, karismaattisen nuoren aktivistin.

Hanna ei saa Abbasia mielestään ja rikkoo protokollaa vieraillen tämän luona turvatalossa. Marissan maailma romahtaa, kun hän tunnistaa puheenjohtajan Hannan valokuvasta. Hanna ja Marissa aikovat estää seuraavan salamurhan, mutta pieni virhe herättää epäilykset. Hanna pysäyttää tutkimaan lähetetyn Utraxin agentin, mutta Carmichael paljastuu, mikä johtaa Hannan ja Marissan väijytykseen.

Paljastuttuaan Hanna ja Marissa toimivat nopeasti. He aikovat suunnata Wieniin uskoen sen olevan Pioneerin päämaja ja salamurhaohjelman tukikohta, mutta Hanna lähtee ensin etsimään Abbasia. Marissa jatkaa Wieniin. Kumpikaan ei tiedä, että ovat joutumassa ansaan.

Hanna ja Marissa murtautuvat Pioneerin päämajaan ja saavat selville karmean totuuden murhalistasta ja sen laatimisesta. Marissa ottaa yhteen puheenjohtaja Evansin kanssa päämajassa, ja Hanna pakenee mukanaan todisteet ohjelman tuhoamiseksi.

Hanna ja Marissa ovat kohtaamassa tappion. Evans pitää Hannaa vankinaan, ja Marissan hallussa olevat todisteet ohjelman tuhoamiseksi ovatkin kryptattuja ja käyttökelvottomia. Yrittäessään pakoa Hanna löytää mahdollisen avaimen Pioneerin tuhoamiseen, mutta Evansin raaka kuulustelu saattaa murtaa Hannan ennen kuin hän ehtii käyttää sitä.

Hanna ja Marissa palaavat Pioneerin päämajaan vankeina, mutta heidän aikeenaan on päästä käsiksi ohjelman tuhoamisessa tarvittaviin todisteisiin. Tajutessaan Abbasin tyttärineen olevan vaarassa he rientävät pelastamaan näitä. Metsässä Wienin ulkopuolella Hannan on pelastettava Abbas, kun Marissa ottaa vielä kerran yhteen Evansin kanssa.