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Während des frühmorgendlichen Berufverkehrs entgleist im einsam gelegenen Santa Clarita Valley ein Pendlerzug.

Jack rintraccia Andrew, un amico di Chloe, che ha scoperto un pericoloso virus informatico che potrebbe essere connesso agli attacchi.

Nachdem Jack Bauer und die CTU durch den gefassten Terroristen Sherak von der geplanten Entführung des Verteidigungsministers erfahren haben, wird sofort eine Polizeieinheit zum Haus von dessen Sohn Richard geschickt.

In einer Telefonkonferenz informiert die CTU-Chefin den Präsidenten über die Entführung seines Verteidigungsministers und über die Terrordrohung der Gruppe um den Top-Terroristen Omar.

Als Erin Driscoll erfährt, dass Andrew in ein Hospital gebracht wurde, ahnt sie sofort, dass Jack dahinter steckt. Darüber hinaus verdächtigt sie Chloe, Jack hinter ihrem Rücken zu unterstützen, und ordert eine Überwachung von ihrem Computer an.

Bei der CTU geht ein Anruf der Polizei ein, die Jack Bauer für einen gewöhnlichen Kriminellenhalten hält und ihn festnehmen will. Driscoll bestätigt widerwillig, dass Jack für die CTU arbeitet und die Geiselnahme ein Undercover-Einsatz war.

Während Hellers Anklage durch Omar beginnt, gelingt es Jack, in das Lagerhaus einzudringen. Präsident Keeler ist jedoch nicht bereit, den Angriff auf den Terroristenstützpunkt abzublasen, erst will er abwarten wie die Lage sich entwickelt.

In der CTU-Zentrale gehen Curtis und Edgar mit ihren Mitarbeitern die Worst-Case-Szenarios für den Fall durch, dass es in den von Terroristen manipulierten Atomkraftwerken tatsächlich zur Kernschmelze kommt.

Jack informiert Heller per Telefon darüber, dass es in der Zentrale einen Verräter geben muss. Jack schlägt vor, den Schuldigen mittels einer Methode ausfindig zu machen, die sie schon einmal in Melbourne eingesetzt haben.

Nachdem Marianne als die undichte Stelle innerhalb der CTU identifiziert worden ist, diskutieren Driscoll und Curtis, wie es passieren konnte, dass sie überhaupt eingestellt wurde, obwohl Curtis eindringlich vor ihr gewarnt hatte.

Jack setzt seine Kollegen in der CTU-Zentrale davon in Kenntnis, dass Navi seinen Sohn als Geisel genommen hat. Durch einen Thermoscan des Krankenhauses steht schnell fest, dass die beiden sich im Wäscheraum befinden.

Paul ist wieder zu sich gekommen und Jack befragt ihn. Er will herausfinden, ob Paul über seine Firma in Verbindung zu den Terroristen steht. Als Audreys Noch-Ehemann jedoch alles abstreitet, versetzt Jack ihm mit einen Stromkabel einige Elektroschocks.

Marwan gelingt die Flucht aus dem Rockland-Hochhaus. Während in der CTU-Zentrale die Suche nach dem Top-Terroristen koordiniert wird, findet Edgar heraus, dass dieser bei der Firma angestellt war, die die atomaren Überbrückungsgeräte herstellt.

Jack und Paul werden von einer mobilen Eingreiftruppe der Firma McLennan-Forster verfolgt, die unbedingt verhindert will, dass die Verstrickungen des Unternehmens mit dem internationalen Terrorismus an die Öffentlichkeit gelangen.

Nachdem Paul Jack das Leben gerettet hat und dabei lebensgefährlich verletzt wurde, wird er in der Klinik der CTU einer Notoperation unterzogen. Verteidigungsminister Heller bespricht derweil mit Präsident Keeler die Lage.

Dinas Leiche wird von der Polizei in einem Lieferwagen gefunden, doch von Jack fehlt weiterhin jede Spur. Anderson bekommt derweil auf dem Luftwaffenstützpunkt unerwartete Probleme, da der Jäger, den er eigentlich nehmen wollte, technische Probleme hat.

Tony und Michelle unterrichten den Präsidenten über die jüngsten Geschehnisse. Daraufhin entscheidet sich Keeler, nach Los Angeles zu fliegen, um dort eine Pressekonferenz zu geben.

Die Air Force One ist von dem Tarnkappenbomber getroffen worden und befindet sich im Sturzflug. CTU-Chefin Michelle schickt Rettungsteams der CTU-Los Angeles und CTU-Las Vegas an die voraussichtliche Absturzstelle.

Obwohl Marwan nur einige Seiten der nuklearen Aktivierungscodes aus dem "nuklearen Football" stehlen konnte, herrscht helle Aufregung in der CTU: Die Seiten enthalten Aktivierungscodes und Standorte einiger Sprengköpfe.

Nachdem Prado durch Jack Bauers rabiate Verhörmethoden Marwans Versteck in einem Nachtclub in L.A. verraten hat, macht sich sofort ein SWAT-Team zusammen mit Jack und Curtis auf

Palmer soll Präsident Logan, der sich in einem Bunker unter dem weißen Haus aufhält, unterstützen und beraten. Logan fühlt sich der Aufgabe, das Land zu führen, nicht alleine gewachsen.

Der chinesische Konsul ist während der Entführung des Marwan-Komplizen Lee Jong durch die CTU an seinen Verletzungen gestorben. Jack Bauer muss dafür sorgen, dass alle seine Leute ein wasserdichtes Alibi haben…

Die CTU kann den mit einer Tarnvorrichtung ausgerüsteten Marschflugkörper der Terroristen nicht orten. Weil die Rakete jedes Ziel in den USA erreichen kann, vermuten Palmer, Logan und Novick, dass der Anschlag Washington D.C. gelten wird.

Jack befürchtet, dass Tony sich in der Gewalt der Terroristin Mandy befindet. CTU-Chefin Michelle schickt Curtis mit einem Team von CTU-Agenten und Einheiten der LAPD, um ihn aus ihrer Gewalt zu befreien.