Thomas se une a las pequeñas locomotoras y a su amiga Marion en la construcción de una nueva vía. Thomas quiere demostrar lo útil que es, pero cae dentro de una caverna escondida y encuentra un viejo barco pirata. Pronto, una emocionante aventura comienza cuando Thomas se une al Marinero John y a Skiff en la búsqueda del tesoro perdido del pirata.
