Amate, una chica de secundaria, conoce a una contrabandista llamada Nyaan y se ve involucrada en una tienda ilegal de artículos usados. El Zaku de la policía militar inicia combate dentro de la colonia contra el Gundam Rojo que violó el espacio aéreo. Perdida en el caos, Amate conduce el GQuuuuuuX.

Char, un piloto de élite del Principado de Zeon, captura el más reciente mobile suit Gundam de la Federación de la Tierra, una pieza clave de su "Operación V", en Side7. A partir de ese momento, el curso de la guerra cambia dramáticamente, llevando finalmente a la victoria del Principado de Zeon en la Guerra de un año. Sin embargo, justo antes del fin de la guerra, Gundam y Char...

Amate conoce a un chico llamado Shuji, quien pilotea el Gundam Rojo. Ella no puede olvidar la sensación cuando vio esa luz brillante que experimentó junto a Shuji. Deben formar un MAV para participar en las Clan-bats. Amate decide usar su apodo "MACHU".