La liceale Amate incontra per caso una contrabbandiera di nome Nyaan e viene coinvolta come rigattiera illegale. Lo Zaku della polizia militare inizia a combattere all'interno della colonia contro il Gundam Rosso che ha violato lo spazio aereo. Coinvolta nel caos, Amate pilota il GQuuuuuuX.

Char, un asso delle forze del Principato di Zeon, cattura l'ultima tuta mobile Gundam della Federazione Terrestre, componente chiave della loro "Operazione V", a Side 7. Da quel momento, le sorti della guerra cambiano radicalmente, portando alla vittoria del Principato di Zeon nella Guerra di un Anno. Tuttavia, poco prima della fine della guerra, Gundam e Char...

Amate incontra un ragazzo di nome Shuji, che pilota il Gundam Rosso. La ragazza non riesce a dimenticare la sensazione dell'universo incandescente che hanno vissuto insieme e propone di formare un MAV per partecipare alla Battaglia tra Clan. Amate decide di usare il nome "MACHU".