엑스파일

죽어가는 어머니를 살리기 위해 멀더는 무자비한 외계인 현상금 사냥꾼으로부터 외계인 치유자 제레마이어 스미스를 보호해야 한다.

뒤틀린 살인범을 잡기 위해 멀더와 스컬리는 살인범이 자신도 모르게 남긴 단서들, 즉, 그의 가장 어두운 환상과 공포를 드러내는 심령사진을 해독하려 한다.

작지만 평화로운 마을에서 요원들은 충격적인 선천적 결함을 가진 유아의 죽음을 조사하는데, 단서의 흔적은 유전적 돌연변이 종족으로 이끈다.

흑인 여러 명의 시신이 몸에 피부 색소가 전혀 없는 상태로 발견되고, 멀더와 스컬리는 생존을 위해 인간의 호르몬을 섭취해야 하는 아프리칸 킬러를 추적한다.

한 종파를 조사하던 멀더는 전생에 지인이었을 수 있는 한 여인을 만난다.

유명 병원에서 일련의 살인 사건이 일어나고, 멀더와 스컬리는 흑마술을 통해 자신의 수명을 연장하는 성형외과 의사의 행방을 쫓는다.

멀더와 스컬리를 방해하던 보이지 않는 적의 비밀스러운 역사는 JFK 암살과 51구역의 악명 높은 UFO 은폐 사건의 진실을 드러낸다.

예언처럼 보이는 꿈을 좇아 아직 발견되지 않은 연쇄 살인범의 피해자를 찾아 나선 멀더는 그중 한 명이 자신의 실종된 여동생 사만다일 수도 있다는 것을 알게 된다.

이상한 바위 안에서 점성이 있는 치명적인 유기체가 발견되자 요원들은 바위의 근원을 알아내기 위해 경쟁한다.

바위 안의 유기체가 외계 생명체라는 확실한 증거를 얻기 위해 이중적인 크라이첵과 힘을 합친 멀더는 끝을 알 수 없는 크라이첵의 속임수와 마주한다.

멕시코의 한 이주 캠프에서 일련의 초자연적인 죽음이 발생하자, 멀더와 스컬리는 피를 빨아먹는다고 알려진 신화적인 생명체 ‘추파카브라’를 추적한다.

유대 교파인 하디시즘 공동체 내부에서 발생한 증오 범죄를 조사하던 요원들은 죽은 사람이 저지른 것으로 보이는 살인을 발견한다.

자신의 삶에 환멸을 느낀 스컬리는 문신의 질투로 자신이 만나는 여자를 어쩔 수 없이 살해하는 위험한 낯선 남자와 데이트를 시작한다.

목이 잘린 구급 대원의 시신이 되살아나자, 요원들은 그가 재생이 가능한 진화된 괴물이 아닐까 의심한다.

스컬리는 수술이 불가능한 암을 받아들이려 하고, 멀더와 외로운 총잡이들은 스컬리의 생명을 구할 수 있는 치료법을 찾기 위해 보안이 철저한 연구소에 침입한다.

눈에 보이지 않는 암살자가 군 간부들을 살해하자 멀더와 스컬리는 피해자가 자신을 보지 못 하도록 하는 능력을 지닌 적의를 품은 베트남인 수의사를 체포한다.

설명할 수 없는 상업용 여객기의 추락 사건을 조사하던 요원들은 황량한 호수 바닥에서 놀라운 발견을 하게 된다.

멀더와 스컬리는 불운한 여객기에 탑승한 승객들이 훔친 외계 기술을 뒤쫓던 군에 의해 고의로 희생됐다는 것을 증명하는 일에 착수한다.

연구 과학자 여러 명이 얼어 죽은 채 발견되자, 멀더와 스컬리는 미래에서 온 시간 여행자를 범인으로 의심한다.

작은 마을, 꼬리 흔적을 몸이 지니고 태어난 아기들의 생부는 멀더를 포함해 모든 사람을 흉내 낼 수 있는 카멜레온 같은 남자인 것으로 밝혀진다.

스컬리의 생명을 구하기 위한 거래에 발목이 잡힌 스키너는 담배 피우는 남자가 치명적인 벌 공격의 증거를 인멸하는 것을 돕지만, 결국 자신이 살인 누명을 썼다는 것을 알게 된다.

여성 희생자들의 유령 같은 이미지가 살해 현장 근처에 나타나자, 멀더와 스컬리는 그 유령이 그들을 보는 사람들에게 죽음의 전조일 수도 있다고 결론짓는다.

피투성이가 된 채 기억상실증에 시달리던 멀더는 지난 며칠 동안의 사건들을 짜 맞추려 하지만, 그 자취는 멀더의 무기로 저지른 것처럼 보이는 이중 살인으로 이어진다.

멀더는 캐나다의 산에서 발견된 얼어붙은 것이 외계 생명체의 반박할 수 없는 증거라는 것을 증명하기 위해 싸우지만, 진실을 향한 그의 탐구는 더 많은 거짓과 생각할 수 없는 결론으로 이어진다.