Premiera sezonu. Około trzech miesięcy po finale pierwszego sezonu, U.S.S. Cerritos wyrusza na misję, podczas której napotyka "dziwną energię".

Bohaterowie nie umieją się dogadać z chorążym Jetem Manhaverem, który przejął pryczę i stanowisko Boimlera. Tymczasem widzimy, że służba na U.S.S. Titanie obfituje w znacznie cięższe przeżycia, niż spodziewał się Boimler.

Tendi wzywa Mariner do pomocy z zadaniem dla doktor T’Any. Rutherforda pochłania zagadka dotycząca członka załogi mostka U.S.S. Cerritosa.

U.S.S. Cerritos zostaje wysłany, by ustalić, skąd na planecie wziął się groźny Mugato.

Mariner i Boimler usiłują dostać się na legendarną imprezę Floty Gwiezdnej, podczas gdy załoga mostka użera się z zakompleksionym dyplomatą obcej rasy.

Załoga niskich pokładów ma mieszane uczucia odnośnie sprzątania anomalii na Cerritosie. Kapitan Freeman usiłuje wynegocjować pokój na planecie Pakledów.

Mariner i Boimler rozbijają się na bezludnej planecie ze świadomym komputerem. Komandor podporucznik Billups musi dowieść talentu inżynierskiego przed dawnym wrogiem.

Na pokładzie Cerritosa zjawia się konsultantka, prowadząca ćwiczenia, w których załogi dolnych pokładów i mostka zamieniają się rolami.

Boimler usiłuje znaleźć towarzysza na mostek, a reszta załogi odpoczywa podczas długiej podróży.

W finałowym odcinku sezonu U.S.S. Cerritos pomaga statkowi klasy Excelsior w nawiązaniu pierwszego kontaktu.

Your favorite scrappy underdogs of the U.S.S. Cerritos return with exciting new adventures. The new season of "Star Trek: Lower Decks" premieres August 12, exclusively on Paramount+.