Aan het einde van de 24e eeuw, 14 jaar na zijn uitdiensttreding bij Starfleet, leeft Jean-Luc Picard (Patrick Stewart) een rustig leventje op zijn wijngaard, Chateau Picard. Maar wanneer hij bezocht wordt door een mysterieuze jonge vrouw - Dahj (Isa Briones) - die zijn hulp nodig heeft, beseft hij dat zij misschien persoonlijke banden heeft met zijn eigen verleden.

Picard onderzoekt het mysterie van Dahj en wat haar bestaan betekent voor de Federatie. Zonder de steun van Starfleet moet Picard hulp zoeken bij anderen, waaronder dr. Agnes Jurati (Alison Pill) en een vervreemde oud-collega, Raffi Musiker (Michelle Hurd). Tegelijkertijd zijn verborgen vijanden ook erg geïnteresseerd waar Picards zoektocht naar de waarheid over Dahj naartoe gaat.

Zonder enig besef van haar bijzonderheid gaat Soji verder met haar werk, en trekt ze de aandacht van de directeur van het Borg-kubusonderzoeksprogramma. Picard haalt oude herinneringen op met de ongewillige Raffi, en zoekt meer mensen die mee op zoek willen gaan naar Bruce Maddox, zoals de piloot en voormalige Starfleet-officier Cristóbal Rios (Santiago Cabrera).

De reis naar Freecloud loopt anders dan verwacht wanneer Picard een stop wil maken op Vashti, waar Picard en Raffi 14 jaar geleden Romulaanse vluchtelingen hebben gehuisvest. Bij aankomst ontmoet Picard Elnor (Evan Evagora) opnieuw, een jonge Romulaan met wie hij tijdens de huisvesting bevriend raakte. Ondertussen wil Narek meer over Soji te weten komen, en raakt Narissa ongeduldig nu hij zo...

De bemanning van La Sirena begint een onvoorspelbare en levendige expeditie op Freecloud op zoek naar Bruce Maddox. Wanneer ze ontdekken dat Maddox in een moeilijke situatie verzeild is geraakt, biedt een bekend gezicht haar hulp aan.

Picard en de anderen ontdekken dat Soji aan boord van een Borg-kubus binnen Romulaans gebied is, wat voor Picard beklemmende herinneringen terugbrengt. Ondertussen denkt Narek eindelijk een manier gevonden te hebben om veilig informatie uit Soji te krijgen.

Picard en Soji begeven zich naar de planeet Nepenthe, waar oude vrienden wonen. Terwijl de rest van de bemanning van La Sirena zich bij hen probeert te voegen, helpt Picard Soji om haar nieuwe herinneringen op een rijtje te krijgen. Ondertussen zijn Hugh en Elnor nog op de Borg-kubus en moeten ze het opnemen tegen een kwade Narissa.

Wanneer schokkende feiten omtrent de aanval op Mars bekend worden, ontdekt Picard hoe ver sommigen gaan om generaties oude geheimen te bewaren, terwijl de bemanning van La Sirena worstelt met hun eigen geheimen en onthullingen. Narissa geeft haar bewakers de opdracht om Elnor gevangen te nemen, waarmee ze een onverwachte reeks gebeurtenissen veroorzaakt op de Borg-kubus.

Na een ongebruikelijke en gevaarlijke reis, komen Picard en de bemanning eindelijk aan op Soji's thuiswereld Coppelius. Maar met de Romulaanse oorlogsschepen op hun hielen brengt hun komst alleen maar meer gevaar met zich mee, en ontdekt de bemanning onverwachte dingen over de bewoners van de planeet.

Bij een laatste confrontatie op de synth-thuisplaneet Coppelius moeten Picard en zijn team het opnemen tegen zowel de Romulanen als de synths, die tegen elke prijs hun voortbestaan veilig willen stellen.