Mobile Suit Gundam SEED

Mientras Orb sigue con sus esfuerzos por la paz, un grupo ataca un hangar militar y hace estallar de nuevo la primera chispa de la guerra.

Aquellos que buscan la guerra

Disparos de advertencia

Campo de batalla estrellado

Cicatrices que no sanan

El fin del mundo

Tierra de confusión

Con el regreso a Orb Cagalli se encuentra a sus ministros dispuestos a firmar un tratado con la Alianza y el resto de países del mundo con el único objetivo de colaborar a solucionar la crisis vivida por la caída de Junius Seven. La verdad, sin embargo, va más allá y es una nueva chispa para iniciar una guerra entre Naturals y Coordinators.

La Alianza Terrestre y sus aliados se preparan para lanzar el ataque contra las PLANT, quienes todavían intentan negociar para resolver la situación. Sin embargo el ataque que tienen planeado será mucho más brutal de lo que nadie habría imaginado.

Tras el ataque de la Alianza Terrestre, Orb y las PLANT buscan la solución al conflicto, aunque cada cual tiene sus propias ideas sobre si dar inicio a una guerra o no.

La Minerva recibe un inquietante mensaje mientras en Orb el consejo se plantea la posibilidad de unirse a la Alianza Terrestre únicamente por el bien de su pueblo. Aunque Cagalli se opone, Yuna intenta convencerla de que es la opción más realista para mantener la nación a salvo.

La Minerva parte de Orb ante su inminente alianza con la Federación Atlántica, pero en Orb los han vendido como parte de su acuerdo para firmar la paz. Con la Federación delante y las fuerzas de Orb detrás, la situación para la capitana es complicada como nunca.

Mientras en Orb Yuna intenta casarse con Cagalli para controlarla y evitar su relación con los Coordinators, estos envían a sus fuerzas especiales para acabar con Lacus.

La boda entre Yuna y Cagalli acelera su ritmo para estabilizar la situación política en Orb, pero Kira y la Minerva saben que ese camino, el del sacrificio en pos de la guerra, no lleva a ninguna parte.

Cuando Athrun acude a Orb se encuentra con la nueva realidad de la nación y su rechazo, descubriendo que la Minerva ya no está allí. Al regresar, él y su capitana reciben nuevas órdenes para intervenir en Gibraltar.

Un nuevo enfrentamiento con Mobile Suits destapa que hay una base enemiga cerca de Carpentaria, donde se entablará una encarnizada lucha en la que Shinn tomará una serie de importantes decisiones.

La crisis interna en la Alianza copa las noticias de todo el mundo mientras las PLANT intentan mostrar su buena fe tras lo ocurrido. En la Minerva dudan de las intenciones de Durandal, pero llegan a la base Mahamul dispuestos a cumplir órdenes.

Un ataque a Gulnahan y a su impenetrable desfiladero necesitará de la pericia de Shinn y el Impulse. La confianza de Athrun en el joven confunde a este, cuyo orgullo le impide ver la realidad.

Athrun y compañía visitan Dicocuia, donde podrán relajarse un poco tras los últimos acontecimientos. La llegada del presidente Durandal les hará entablar una conversación que les descubrirá un lado de la guerra en el que ellos no habían pensado.

Shinn recapitula lo ocurrido en el conflicto entre Naturals y Coordinatos desde su punto de vista.

Los pilotos de la Minerva tienen un día libre en el que que cada cual lidia con sus circunstancias: Athrun con Lacus, Lunamaria con sus celos y objetivos, y Shinn con un inesperado encuentro.

Orb acude a la llamada de la Alianza para proporcionar refuerzos y atraer a ZAFT con intención de destruir la Minerva. Shinn y Athrun tienen sentimientos encontrados con la situación, pero deben obedecer órdenes.

Con Orb en pleno combate contra la Minerva, aparecen Kira y Cagalli con la intención de hacer que las tropas de la nación neutral se retiren. Sin embargo Yuna no parece dispuesto a cambiar de planes.

Athrun quiere verse con Kira y Lacus para hablar sobre su intervención reciente, la cual considera incorrecta. Los viejos amigos vuelven a estar en bandos separados, aunque su objetivo sigue siendo el mismo.

El descubrimiento de un laboratorio lleva a que se revele cómo crean en la Alianza a los Extended: experimentando con niños y sometiéndolos a un cruel destino donde sus propias vidas están en juego.