The Fruit of Grisaia

Asako Kusakabe rescata a una joven Yuuji de los terroristas en una misión. Ha evadido la muerte como soldado una y otra vez, y decide convertise en guardían de Yuuji. Aunque parcialmente lo forza, y a pesar de las preocupaciones de JD, la rara soldado y el joven deciden vivir bajo el mismo techo.

Yuuji Kazami continúa contando su historia y cómo dio sus primeros pasos para convertirse en agente especial de CIRS.

La historia de Yuuji prosigue, nos hablará de su pelotón y del tiempo que pasaron en el frente entre la vida y la muerte.

Yuuji narra los últimos momentos con su tutora y amante. De vuelta al presente, Yuuji recibirá una nueva misión como el agente 9029.

Yuuji es acusado de colaborar en un acto de terrorismo y detenido por ello. En la Academia, las chicas deciden investigar su paradero, para así actuar en consecuencia. ¿Qué harán cuando lo averigüen?

Kazuki le explicará a Yuuji cómo ha llegado a convertirse en el sistema Thanatos. Mientras, las chicas continúan pensando cómo salvarlo.

Bajo la supervisión de Thanatos, las chicas se preparan para el rescate de Yuuji. Cada una de ellas recibe una misión diferente, que deberán cumplir antes de poder rescatarlo.

Con todos los cabos atados y la ayuda de Thanatos, ya solo falta rescatar a Yuuji. Las chicas deciden iniciar el plan y recibirán una ayuda inesperada.

Una vez están todos reunidos, solo queda que Yuuji decida el plan de acción: cortarse el brazo con la bomba y huir o ir a buscar a Oslo y saldar cuentas.

Yuuji se abre paso implacable para acabar con Oslo, solo él mismo se interpone en su camino...