A Certain Scientific Railgun

Haru'ue macht mit Saten und Uiharu einen Ausflug in den Garten des Lernens, um Misaka und Shirai zu besuchen und einzukaufen. Später besuchen sie Edasaki im Krankenhaus, wo sie sich einer Physiotherapie unterzieht, als die Dinge eine unerwartete Wendung nehmen.

Nachdem sie von ihrer Vergangenheit geträumt hat, macht sich Misaka auf den Weg zum Einkaufen, aber als Kuroko eine Abkürzung vorschlägt, finden sie einen Umschlag mit einer Geldkarte darin - eine von vielen, die in der ganzen Stadt verteilt sind. Anderswo glaubt Saten, jemanden zu sehen, der wie Misaka aussieht.

Rumors swirl about that Misaka is the template for a project to produce Level 5 clones. When Nunotaba refers to her as the "Original," Misaka decides to check her out, and learns that she worked at the hospital where Misaka submitted her DNA map.

Gut gelaunt schließt sich Misaka den anderen Mädchen für einen Einkaufstag bei Seventh Mist an, wo sie auch den anderen beim Einkaufen hilft. Misaka verbringt einen weiteren Tag damit, mit Kindern zu spielen. Einer von Misakas Klonen durchläuft die Phasen ihrer Ausbildung.

Finding herself face-to-face with a clone of herself, Misaka ends up helping her get a cat out of a tree, sharing ice cream cones, and having tea with her. It isn't until later that Misaka discovers the true, sinister project that calls for her clones.

Misaka lashes out at Accelerator, but is left frustrated. She realizes the full breadth of the situation she has become involved in, and feels responsible for allowing it to happen. Nunotaba discusses the ramifacations of the clones' existence with Misaka.

Misaka manages to sabotage most of the experimental facilities remotely before she is cut off, leaving her to deal with the rest in person. Shirai resolves to help Misaka by doing her part to be more vigilant at work, but risks shutting the others out.

Die Mitglieder der Unterweltorganisation ITEM beenden eine Mission und werden gerufen, um die übrigen Einrichtungen zu verteidigen. Als Misaka versucht, in ein Gebäude einzudringen, trifft sie auf das ITEM-Mitglied Frenda. Währenddessen schaut Nunotaba in der anderen Einrichtung vorbei.

Während Misaka ihren Weg in die Forschungseinrichtung fortsetzt, spielen sie und Mugino ein Katz-und-Maus-Spiel. Währenddessen schleicht sich Nunotaba in der anderen Einrichtung in einen Kontrollraum und plant, das Experiment zu stören, indem er dem Misaka-Netzwerk einen neuen Faktor hinzufügt.

Nachdem sie erkannt hat, wer Misaka ist, beschließt Mugino, ihr ihren dritten Platz streitig zu machen. Als Frenda auf dem Weg zur anderen Einrichtung versehentlich ihre Puppenbomben zurücklässt, sammelt Misaka sie ein und benutzt sie, um ihre verminderten Kräfte zu ergänzen.

Misaka und Kamijo treffen sich an einem defekten Automaten im Park wieder, wo Shirai ihn für Misakas Freund hält. Misaka wird erschüttert, als sie auf einen anderen Misaka-Klon trifft und erfährt, dass die Experimente immer noch laufen.

Misaka sets out on one last mission to put a halt to the experiments by destroying the supercomputer Tree Diagram. Meanwhile, Kamijo runs into Misaka's clone #10032 again, and the two of them decide what they should do about a stray kitten she has found.

Als ihr Versuch, das Baumdiagramm zu sabotieren, scheitert, lässt Misaka ihren Frust an einem nahe gelegenen Labor aus, das Teil des Projekts ist. Währenddessen führen Accelerator und #10031 ihr Experiment durch, während Kamijo nach Misakas vermisster Schwester sucht.

Während Shirai sich darüber aufregt, dass Misaka wieder die ganze Nacht wegbleibt, erhält sie Besuch von Kamijo, dem es gelingt, Misakas Unterlagen über das Projekt zu finden. Kamijo holt Misaka auf einer Brücke ein, wo er versucht, sie davon abzubringen, etwas Unüberlegtes zu tun.

Kamijo races to the scene of the experiment, only to find that it has already started. Kamijo calls out Accelerator, who takes him to be yet another challenger to his position, until for the first time, as Misaka watches on, he gets his nose bloodied.

Misaka setzt sich für Klon #10032 ein und erklärt, dass sie dies tut, weil sie Schwestern sind. Am nächsten Tag verbringen die beiden Zeit in einem Park, wo 10032 sie um einen besonderen Gefallen bittet. Später fällt es Misaka schwer, Kamijo ihren Dank auszudrücken.

Das Ende der Sommerferien rückt näher, und die Mädchen planen eine Lerngruppe in Saten's Wohnung, um ihre Hausaufgaben nachzuholen. Jeder soll eine Zutat für eine Eintopfparty mitbringen, aber die meisten haben Schwierigkeiten zu entscheiden, was sie kaufen sollen, was zu einigen Überraschungen führt.

Edasaki is due to be discharged from the hospital, and it is learned that she will be living with Haru'ue. The move is bittersweet for Uiharu, who is losing her roommate, but she feels it is for the best. Meanwhile, a new movement is afoot in the city.

Febrie findet sofort Gefallen an Saten und ist zu jedem freundlich, außer zu Misaka, sehr zu ihrem Leidwesen. Bei der Urteilsfindung kann Uiharu keine Informationen darüber finden, wer Febrie ist, also werden Vorkehrungen getroffen, sie als "Kinderfehler" in ein Waisenhaus aufzunehmen.

Während Yomikawa die Ermittlungen gegen die entlaufenen Sicherheitsroboter übernimmt, lädt Konori die ganze Bande zu einem Bad in einem Badehaus ein. Auf dem Heimweg führt eine Reihe von Umwegen zu einer Konfrontation mit einem weiteren, viel gefährlicheren entlaufenen Roboter.

Nach der Enthüllung, dass Febrie synthetisch ist, ist Misaka entschlossen, denjenigen zu finden, der sie gebaut hat, und ihn dazu zu bringen, sie zu reparieren. Die Ermittlungen kommen an allen Fronten ins Stocken, selbst mit der Hilfe ihrer Freunde, die Spuren verfolgen, bis Hilfe von einer überraschenden Quelle kommt.

Therestina gibt Misaka widerwillig die Hinweise, die sie braucht, um die Gruppe hinter Febries Geheimnis zu finden. Mit Kongos Hilfe identifizieren die Mädchen Aritomi als den Mann, den sie verfolgen, und finden mehr über ihn und seine Firma, die STUDY Corporation, heraus.

Aritomi reveals his motivations for STUDY's project to Misaka. She also learns about Nunotaba's plight, and some of the details concerning what STUDY has planned at the Reach Assembly the next day. Will she be able to escape and put a stop them?

Shirai, Konori, Kongo und seine Freunde sowie Uiharu und Saten stellen sich den Power Suits an den vier Versammlungsorten entgegen, wo sie bald Verstärkung erhalten. Misaka und Febrie wollen Aritomi direkt angreifen, aber er hat noch eine letzte Überraschung für sie parat.