Ayato Kamina est un jeune lycéen de 17 ans, passionné de peinture, aspirant à une vie paisible. Alors qu’il se rend en cours avec deux de ses camarades de classe, le métro qu’ils empruntent subit un terrible accident : ils découvrent avec effroi que Tokyo est sous le joug de mystérieux envahisseurs humanoïdes, les Muliens. Mais sa rencontre avec Haruka Shitô bouleverse le quotidien du jeune garçon
