Stargate Atlantis

Samantha Carter monte une mission de secours pour venir en aide aux habitants d'un monde victime d'explosions massives. Mais, Michael et sa nouvelle armée de Super Wraiths se dirigent également vers cette planète !

Alors que Woolsey prend ses fonctions à bord de la station, le docteur Keller est victime d'une maladie, contractée durant le sauvetage des survivants. Le docteur Beckett est sorti de sa stase pour trouver une solution à ce mystérieux problème.

Ronon est capturé par Tyre, qui compte le livrer aux Wraith afin de regagner sa place parmi eux. Pour faire de Ronon l'un des leurs, les Wraiths procèdent à un lavage de cerveau. Sheppard se lance à la rescousse de son camarade.

Un vaisseau identique au Dédale apparaît inexplicablement au milieu de la galaxie, à la dérive et abandonné. Sheppard et son équipe décident de mener l’enquête.

Le réseau informatique de la station Atlantis subit une panne importante. Une mystérieuse entité extraterrestre aurait saboté tous les systèmes. L'équipe tente de reprendre le contrôle de la cité.

Rodney McKay souffre de la maladie de Pégase, dont les symptômes ressemblent fortement à ceux d’Alzheimer. Son état a été diagnostiqué trop tard pour le soigner mais Ronon pourrait bien avoir la réponse qui le sauvera.

Alors qu'elle parcourait des catacombes abandonnées sur une planète inexplorée, une équipe d'Atlantis, dont fait partie le docteur Beckett, découvre l'un des labos secrets de Michael. Elle se retrouve alors confrontée à des créatures mutantes agressives.

Le docteur Keller a mis au point une génothérapie permettant aux Wraiths de ne plus se nourrir d'humains. Teyla tente se faire passer pour une souveraine Wraith afin de proposer cette solution à leur Reine.

L'équipe arrive pour prêter main forte à un village décimé par les Wraiths. Mais, lorsque le docteur Keller est enlevée par un "runner", leurs plans changent brutalement.

Daniel Jackson est de retour sur Atlantis car ses recherches suggèrent qu'un scientifique rebelle, Janus, y aurait un laboratoire secret. Décidé à retrouver cette cachette, il sollicite l'aide de McKay.

McKay et Daniel se retrouvent dans un entrepôt ayant appartenu à Janus. Là, ils rencontrent un Asgard qui a pour mission d'éliminer les Wraiths. Ce dernier active l'arme de Janus, malgré les protestations de Daniel.

L'équipe de Sheppard localise le docteur Beckett sur une planète où il soigne des victimes de la drogue Hoffan. Ces patients, du peuple Balaran, ont échappé de peu à une attaque Wraith et cherchent refuge sur une autre planète.

L'équipe de Sheppard part négocier avec une coalition de peuples humains de la galaxie Pégase. Sur place, ils constatent qu'ils ont été piégés et qu’ils vont être jugés.

Michael, avide de vengeance, s’introduit de la salle de contrôle d'Atlantis. Il active un champ de protection afin d'empêcher quiconque d'atteindre la salle de la Porte des Etoiles.

Pendant que Woolsey lutte pour garder sa place de chef d'Atlantis, McKay et Zelenka font une découverte déroutante.

Le docteur McKay est invité à participer à une démonstration scientifique de la plus haute importance, organisée par un ancien rival de l'université. Il décide de s'y rendre en compagnie du docteur Keller.

Un rétrovirus, créé par le docteur Keller, décime la population Wraith. Contaminé à son tour, Todd se dirige vers Atlantis pour demander aux humains de l’aider à stopper l’infection.

Le comportement du docteur Keller inquiète ses collègues, qui demandent à Carson Beckett de l'examiner. A son insu, l'esprit de Keller s'est retrouvé prisonnier de l'enveloppe corporelle d’une criminelle notoire, condamnée à mort pour ses crimes.

Dans un univers parallèle, l'inspecteur John Sheppard est à la poursuite d’un tueur en série, qui vient d’éliminer sa septième victime dans le désert de Las Vegas.

Todd contacte Atlantis pour les prévenir que les Wraiths ont réussi à construire un nouveau vaisseau ruche. L’équipe de Sheppard met alors tout en œuvre pour détruire l'engin avant qu'il ne devienne une menace.