Premier épisode de la saison. Starfleet doit à nouveau faire appel au légendaire Jean-Luc Picard quand des membres de son ancien équipage découvrent une anomalie dans l'espace qui menace la galaxie.

Picard se retrouve transporté dans une ligne temporelle alternative en l'an 2400 où son ennemi de toujours, Q, a orchestré un dernier "procès". Picard recherche son équipage de confiance et tente de trouver la cause de ce futur dystopique.

Picard et son équipage voyagent en 2024 à Los Angeles, à la recherche du « guetteur » qui pourrait les aider à identifier l'instant où la divergence temporelle s'est produite. Seven, Raffi et Rios s'aventurent dans l'inconnu en plongeant 400 ans dans le passé, tandis que Picard et Jurati tentent de soutirer des informations à un allié aussi improbable que dangereux.

Alors que le temps presse pour sauver le futur, Picard décide de prendre les choses en main et d'appeler une vieille amie à la rescousse. Pendant ce temps-là, Rios se retrouve du mauvais côté de la loi et Jurati conclut un marché avec la reine borg.

Picard découvre qu'une ancienne connaissance pourrait jouer un rôle prépondérant dans la divergence chronologique. Q continue de manipuler le temps en s'intéressant au Dr Adam Soong. Jurati affronte les conséquences de son accord avec la reine borg.

Picard et l'équipage infiltrent un gala afin de protéger l'astronaute amenée à jouer selon eux un rôle dans la restauration de la chronologie, Renée Picard. Kore fait une découverte bouleversante concernant les travaux de son père.

Tallinn s'aventure dans le subconscient de Picard pour l'aider à sortir du coma, et affronter ses secrets les plus sombres et ses peurs les plus profondes. Seven et Raffi traquent Jurati. Rios s'efforce de cacher sa véritable identité à Teresa.

Le lancement de la Mission Europe approche. Picard et Guinan, emprisonnés par le FBI, tentent de se libérer. Seven et Raffi retrouvent Jurati et découvrent l'abomination qu'elle est devenue.

Picard et son équipage luttent pour leur survie, tandis qu'un vieil ennemi les attaque sous une nouvelle forme. Mais pour y parvenir, Picard doit affronter les fantômes de son passé. Seven et Raffi vivent une confrontation finale avec Jurati.

Dans le final de la saison deux, à quelques heures du lancement de la Mission Europe, Picard et l'équipage se lancent dans une course contre la montre pour sauver le futur.